在PCR（聚合酶链式反应）生物实验中，常用的染料根据用途主要分为以下几类：

一、核酸电泳染色染料（用于检测PCR产物）

1、溴化乙锭（Ethidium Bromide, EtBr）

传统的核酸染料，与DNA结合后在紫外光下发出橙红色荧光。

注意：有潜在致癌性，需谨慎操作。

2、SYBR系列染料（如SYBR Green I/SYBR Gold）

灵敏度高于EtBr，更安全（但仍需防护），需避光保存。

SYBR Green I也常用于实时荧光定量PCR（qPCR）。

3、GelRed/GelGreen

安全性更高（无诱变性），灵敏度与EtBr相当，需紫外或蓝光激发。

其他替代染料：如SYBR Safe、EvaGreen（也可用于qPCR）等。

二、实时荧光定量PCR（qPCR）染料

1、SYBR Green I

非特异性结合双链DNA，通过荧光强度定量产物，需配合熔解曲线分析。

2、EvaGreen

类似SYBR Green，但荧光信号更强，适用于高分辨率熔解曲线分析（HRM）。

3、探针类染料（需特异性设计探针）

TaqMan探针：基于荧光共振能量转移（FRET），标记报告基团（如FAM）和淬灭基团。

分子信标（Molecular Beacon）：发夹结构探针，特异性高。

三、其他辅助染料

1、Loading Dye（上样缓冲液染料）

如溴酚蓝（Bromophenol Blue）或二甲苯青（Xylene Cyanol），用于电泳时指示迁移进度。

2、DNA ladder标记染料

预染的DNA分子量标准（如预混SYBR Green或EtBr）。

根据实验需求（如常规检测、定量、安全性等）选择合适的染料即可。