这是一个非常常见且重要的选择。Qubit 4.0 和 NanoDrop One 是功能互补而非相互替代的仪器。选择哪一个（或者更常见的：是否需要两者）完全取决于您的实验对核酸/蛋白定量准确性的要求。

简单来说：

NanoDrop One：用于快速评估样品的浓度和纯度（通过A260/A280等比值），但准确性相对较低，尤其对于低浓度样品。

Qubit 4.0：用于高度精准、特异地测量特定类型核酸的浓度，但对纯度信息有限，且通量较低。

下面我将从多个维度进行详细对比，并给出Z终建议。

一、根据您的应用场景

1、选择 NanoDrop One 更适合您，如果：

需要快速评估纯度：您想快速知道样品中是否有蛋白质（A260/A280）、盐或有机溶剂（A260/A230）污染。这是NanoDrop无可替代的优势。

样品量充足且浓度较高：例如常规的质粒DNA提取、PCR产物纯化后检测。

预算有限或想控制耗材成本：不需要持续购买昂贵的检测试剂。

进行定性或半定量分析：例如看看样品“有没有”以及“大概多少”。

2、选择 Qubit 4.0 更适合您，如果：

进行高度依赖精确浓度的下游应用：

下一代测序（NGS）：这是必须使用Qubit的领域。NGS文库定量要求极精确，任何污染物或不准确定量都会导致数据量不均或测序失败。

实时荧光定量PCR（qPCR）：准确定量模板DNA/cDNA是获得准确Ct值的前提。

克隆：需要精确知道插入片段和载体的比例。

样品珍贵或浓度很低：例如从稀有样本中提取的DNA、ChIP后的DNA、单细胞RNA等。Qubit的灵敏度远超NanoDrop。

样品成分复杂：样品中可能含有杂质，如盐、蛋白、去污剂、RNA或另一种核酸（如同时有DNA和RNA），您需要特异性地只测量其中一种。

二、典型的工作流程

1、第一步：NanoDrop快速筛查

提取核酸后，先用NanoDrop测量。

看浓度：获得一个大概的浓度范围。

看纯度：检查A260/A280和A260/A230比值是否在理想范围内（如1.8-2.0和2.0-2.2）。如果比值异常，说明样品不纯，可能需要重新纯化，甚至没有必要进行下一步精确定量。

2、第二步：Qubit精准定量

对于通过纯度检查的、要用于关键下游实验（如NGS、qPCR）的样品，再用Qubit进行Z终的精确定量。

确保加到下游反应中的每一个样品的量都是绝对准确的。

三、Z终建议

如果你的预算只允许买一台，且实验要求不高：先从 NanoDrop One 开始。它可以满足大部分教学、本科实验和常规分子生物学实验的初步筛查需求。

如果你从事严格依赖精确定量的研究（如NGS）：Qubit 4.0 是必需品。你甚至可能需要先买Qubit。

理想情况：两者都配备。先用NanoDrop检查纯度并获得粗略浓度，再用Qubit对关键样品进行精确定量。这是目前绝大多数科研实验室的黄金标准。

总结：NanoDrop是“普查工具”，快速且能提供纯度信息；Qubit是“精准工具”，为关键步骤提供可靠数据。请根据您的具体应用和预算做出选择。