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2025-12-22 09:15:27
作者: 高思维医疗
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使用赛默飞Simpliamp梯度PCR仪进行实验时所需的耗材和试剂。这是一套标准而完整的清单,您可以根据您的具体实验方案进行选择和调整。
一、赛默飞Simpliamp梯度PCR仪核心耗材
这些是直接放入PCR仪的消耗品。
1、PCR管或PCR板
(1)类型:必须使用透明、无裙边或半裙边的96孔PCR板或0.2ml单管/8联管。Simpliamp的热盖是平板式设计,与平盖的板/管才能紧密接触,确保热封效果。
(2)材质:推荐使用高质量、超薄壁的聚丙烯管/板,以确保热传导效率和温度准确性。
(3)重要提示:切勿使用有高高凸起管盖的PCR管(如某些品牌的单管),否则热盖无法压紧,会导致反应体系蒸发和实验失败。
2、封板膜或管盖
(1)对于PCR板:使用光学透明的粘性封板膜,确保密封严实,防止蒸发和交叉污染。
(2)对于单管/八联管:确保管盖盖紧。八联管通常有配套的平盖。
二、赛默飞Simpliamp梯度PCR仪核心试剂
这些是构成PCR反应体系的化学成分。
1、PCR主混合物
(1)预混液:常用且方便的是 2× PCR Master Mix。它已经包含了Taq DNA聚合酶、dNTPs、MgCl₂以及优化的缓冲液。您只需加入模板、引物和水即可。赛默飞自家的 Platinum™ SuperFi™ PCR Master Mix 或 DreamTaq™ Hot Start PCR Master Mix 都是兼容性很好的选择。
(2)单独组分:也可以选择单独购买:热启动Taq DNA聚合酶、10× PCR缓冲液、dNTP混合物、MgCl₂溶液。
2、引物
上游引物和下游引物:针对您目标基因特异性设计的寡核苷酸引物。通常使用浓度为10 μM的工作液。
3、模板DNA
可以是基因组DNA、cDNA、质粒DNA等,浓度和纯度需根据实验优化。
4、无菌无核酸酶水
用于补足反应体系体积。至关重要,必须确保无菌且无核酸酶污染,以防止降解和假阴性结果。
三、实验流程简要总结(以使用预混液为例)
1、在冰上配制反应体系(以下为25μL体系的常见比例):
2× PCR Master Mix:12.5 μL
上游引物(10 μM):1.0 μL
下游引物(10 μM):1.0 μL
模板DNA:X μL(通常10pg - 100ng,需优化)
无菌无核酸酶水:补足至 25 μL
2、轻柔混匀并短暂离心,确保所有液体收集在管底。
3、将PCR管/板放入Simpliamp仪器中,确保放置平稳。
4、在仪器控制面板或配套软件上设置程序:
预变性:94-98°C,30秒 - 2分钟。
循环(30-40次):
变性:94-98°C,10-30秒。
退火:在此设置梯度温度(例如50°C - 65°C),这是Simpliamp梯度功能的关键应用,用于快速确定退火温度。15-60秒。
延伸:72°C(对于Taq酶),每1kb延伸30-60秒。5-10分钟。保温:4-10°C。
5、启动运行。
6、程序结束后,取出产物,进行后续的电泳或分析。
梯度功能:Simpliamp的核心优势是可以在同一块板/同一批管子上同时测试多个退火温度。在设置时,您只需要在退火步骤设置一个温度范围,仪器会自动在加热块的不同列生成线性梯度。放置样品时,请根据仪器说明书或屏幕提示,将样品放在对应的列上。
清洁与维护:定期用70%乙醇擦拭热盖和样品槽,防止污染。